Darwinia es un parque de atracciones virtual en un rinconcito apartado de Internet. En él, el Dr. Sepúlveda ha creado una raza de pequeños seres bidimensionales inteligentes llamados “darwinians”. Durante generaciones estos pequeños sprites verdes viven y evolucionan de forma pacífica, pero un virus rojo infesta el mundo de Darwinia y lleva a los darwinians al borde de la extinción. En ese momento apareces tú en el parque y el Dr. Sepúlveda te pide ayuda para erradicar el virus.