Tu objetivo en el juego es combatir a tus enemigos, pero si no lo consigues con éxito se irá decayendo tu salud a medida que pase el tiempo. Cuantos más enemigos elimines, más puntos alcanzarás, pero no debes atacar al personaje elegido, y por ello para evitar ser golpeado debes utilizar hábilmente la barra del espacio.

En MangaFighter hay tres tipos de personajes diferentes: humanos, animales y alienígenas, cinco modalidades de juego y siete escenarios distintos, con todo esto el jugador pasará por situaciones realmente sorprendentes.